Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Otx1P80205 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms