Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb1P70662 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms