Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vamp3P63024 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms