Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lim2P56563 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lim2P56563 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms