Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp5P56399 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp5P56399 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp5P56399 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms