Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad23bP54728 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Rad23bP54728 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Rad23bP54728 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Rad23bP54728 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Rad23bP54728 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Rad23bP54728 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad23bP54728 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Rad23bP54728 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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