Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacnb3P54285 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacnb3P54285 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms