Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Efnb1P52795 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms