Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apobec1P51908 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms