Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms