Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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