Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rom1P32958 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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