Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Saa4P31532 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms