Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxa2P31245 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gm37963-201ENSMUST00000195351 613 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxa2P31245 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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