Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa2P28309 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa2P28309 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa2P28309 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa2P28309 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms