Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2afxP27661 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2afxP27661 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms