Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NdnP25233 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NdnP25233 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
NdnP25233 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms