Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZfaP23607 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZfaP23607 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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