Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsta3P23591 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsta3P23591 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsta3P23591 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsta3P23591 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsta3P23591 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsta3P23591 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsta3P23591 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsta3P23591 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsta3P23591 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsta3P23591 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsta3P23591 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsta3P23591 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsta3P23591 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsta3P23591 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsta3P23591 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsta3P23591 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsta3P23591 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tsta3P23591 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms