Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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