Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Ggta1P23336 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Ggta1P23336 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Ggta1P23336 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Ggta1P23336 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Ggta1P23336 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Ggta1P23336 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Ggta1P23336 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Ggta1P23336 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Ggta1P23336 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Ggta1P23336 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ggta1P23336 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms