Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PparaP23204 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PparaP23204 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PparaP23204 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PparaP23204 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PparaP23204 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PparaP23204 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PparaP23204 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PparaP23204 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PparaP23204 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PparaP23204 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PparaP23204 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PparaP23204 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PparaP23204 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PparaP23204 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PparaP23204 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PparaP23204 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PparaP23204 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PparaP23204 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PparaP23204 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PparaP23204 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PparaP23204 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PparaP23204 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PparaP23204 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PparaP23204 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms