Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18528 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18528 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18528 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18528 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18528 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18528 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18528 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18528 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18528 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18528 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18528 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18528 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18528 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18528 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18528 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18528 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18528 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18528 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18528 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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