Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms