Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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