Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms