Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms