Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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P10404 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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P10404 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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P10404 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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P10404 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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P10404 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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P10404 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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P10404 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P10404 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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P10404 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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