Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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LtaP09225 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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LtaP09225 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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LtaP09225 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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LtaP09225 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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LtaP09225 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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LtaP09225 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
LtaP09225 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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