Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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