Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms