Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CrxO54751 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CrxO54751 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CrxO54751 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms