Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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