Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rab33bO35963 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rab33bO35963 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rab33bO35963 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rab33bO35963 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rab33bO35963 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab33bO35963 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rab33bO35963 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms