Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RaxO35602 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RaxO35602 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RaxO35602 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RaxO35602 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RaxO35602 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RaxO35602 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RaxO35602 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RaxO35602 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RaxO35602 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RaxO35602 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RaxO35602 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RaxO35602 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaxO35602 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaxO35602 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms