Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Clk2O35491 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Clk2O35491 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Clk2O35491 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Clk2O35491 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Clk2O35491 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Clk2O35491 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Clk2O35491 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Clk2O35491 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Clk2O35491 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms