Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sh2d1bO35324 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms