Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smad6O35182 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smad6O35182 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smad6O35182 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smad6O35182 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smad6O35182 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smad6O35182 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smad6O35182 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Smad6O35182 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smad6O35182 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smad6O35182 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smad6O35182 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smad6O35182 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Smad6O35182 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Smad6O35182 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Smad6O35182 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Smad6O35182 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Smad6O35182 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Smad6O35182 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Smad6O35182 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Smad6O35182 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Smad6O35182 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Smad6O35182 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Smad6O35182 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Smad6O35182 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smad6O35182 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smad6O35182 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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