Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Casq1O09165 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casq1O09165 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms