Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20877J3QPZ4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms