Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp616J3QN14 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp616J3QN14 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms