Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm11236J3QMS7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11236J3QMS7 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms