Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm20828J3KMI7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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