Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm29394H3BIW7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms