Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vmn1r58G3X9U3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r58G3X9U3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r58G3X9U3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r58G3X9U3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r58G3X9U3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r58G3X9U3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r58G3X9U3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r58G3X9U3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r58G3X9U3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r58G3X9U3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r58G3X9U3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r58G3X9U3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r58G3X9U3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r58G3X9U3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r58G3X9U3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms