Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Il1f5-202ENSMUST00000114490 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm12664-201ENSMUST00000118306 913 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms