Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Brd1E9PZ26 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms