Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm17333C6EQI3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm17333C6EQI3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm17333C6EQI3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm17333C6EQI3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm17333C6EQI3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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