Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms