Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms